Το Μουσείο διαθέτει στη συλλογή του πλήθος αντικειμένων καθημερινής διαβίωσης των εξορίστων τόσο από τον Αη Στράτη, όσο και από άλλους τόπους εξορίας (Μακρόνησο, Τρίκερι, Χίο, Γυάρο, Λέρο, Ικαρία κ.α.), και φυλάκισης (Φυλακές Αβέρωφ, Αίγινας, Τρίπολης κ.α.). Ο επισκέπτης κατά την διάρκεια της περιήγησης του στις αίθουσες του Μουσείου έχει επίσης την δυνατότητα μέσω αναπαράστασης εσωτερικού σκηνής, με αυθεντικά αντικείμενα- δωρεές από διάφορους παλιούς εξόριστους- και σε συνδυασμό με πλούσιο φωτογραφικό υλικό να ανασυνθέσει τις συνθήκες της καθημερινότητας των εξορίστων γυναικών και ανδρών από τις αρχές του 1920 έως και το 1974. Ιδιαιτερότητα πολλών αντικειμένων, που εκθέτονται και ανήκουν στην μουσειακή συλλογή, είναι η ευρηματικότητα και μοναδικότητα στα υλικά και στον σχεδιασμό τους, αφού στο σύνολο τους αποτελούν αυτοσχέδιες κατασκευές από τους ίδιους τους εξορίστους, όπως ψαροντούφεκα, αναπτήρες, εργαλεία, βαλίτσες κ.α.